鄂托克旗现有高级中学一所，完全中学一所，职业中学一所，九年一贯制学校一所，初中三所，小学九所。2024年秋季，全旗共招录各学段新生共计4743人。其中普通高中录取学生692人，职业高中录取学生339人，义务教育阶段共录取学生3712人，其中初中录取新生1803人，小学录取学生1909人。